生物信息基础系列(三)编程语言及perl语言简介
off999 2025-05-28 19:37 22 浏览 0 评论
前面我们提到，学习生物信息学，需要掌握生物统计学、一门编程语言、还有生物学，那这一节我们开始介绍编程语言，这里先介绍perl语言，对于生物学专业学习生物信息的小伙伴而言，perl语言无疑是一门可以快速入门的编程语言，而且很久以前，很多大佬的生物信息学程序也都是用perl进行编写的（目前生物信息从业者越来越多的使用Python，Python也是一门功能强大，容易入门的编程语言）。
所谓条条大路通罗马，不管是perl语言还是Python语言，都是一门生物信息数据处理工具。
认识perl语言之前，我们首先要简单认识一下，什么是编程语言？我的理解，编程语言就是人与机器间的桥梁，它可以让机器明白我们想要做什么。
编程语言又分为汇编语言、机器语言和高级语言，到目前为止，编程语言的发展经历了低级语言时代、高级语言时代和面向对象时代。
那么，perl语言是什么？perl是实用摘录与报表语言（Practical Extraction and Report Language）的缩写。perl语言可以说是为文本处理而生，perl处理的问题，约有90%与文本处理有关（出自小骆驼）。
perl语言有四大特点：1、容易使用，语法非常易读且“随意”；2、干啥都行，功能上和其他编程语言没有太大区别；3、速度快；4、有点“丑”，因为语法比较随意，对于写习惯C++的小伙伴而言，perl语言的确有点丑。
接下来，我们就要去安装perl和使用perl，perl有其自己的网站CPAN（http://search.cpan.org），在这个网站中可以下载到最新版本的perl，以及所有程序包。
开始编写perl程序之前，我们要先来认识一下perl语言的常用结构，如下：
好了，我们可以开始写我们的第一个perl程序，我们可以使用Notepad++软件（Windows系统下）编辑perl程序，也可以使用vi/vim命令（linux系统下）编辑perl程序：
重要的事情放在最后，写程序一定要有良好的编程习惯：
1、缩进，每个程序都应该按照要求进行缩进，让程序规范易读；
2、注释和代码文档，程序要有注释、有注释、有注释，重要的事情说三遍，注释是写给自己看的，debug的时候，不至于重头读程序；
3、先动脑，后动手，先想好程序设计，在动手实现；
4、写完程序后先测试，没有经过测试的程序，也许得到的结果是错的呢，而且它可能还不报错；
5、警告和错误输出，建议程序中加入警告代码和错误输出信息，方便debug；
6、变量命名，名字要有其意义，增加程序易读性。
……
相关推荐
- 实战:用 Python+Flask+Echarts 构建电商实时数据大屏
-
在电商运营中，实时掌握销售趋势、用户行为等核心数据是决策的关键。本文将从实战角度，详解如何用Python+Flask+Echarts技术栈，快速搭建一个支持实时更新、多维度可视化的电商数据大屏，帮...
- DeepSeek完全使用手册:从新手到高手的2000字实操指南
-
一、工具定位与核心功能矩阵（200字）DeepSeek是一款专注于深度推理的强大AI助手，其功能丰富多样，可归纳为4大能力象限：plaintext差异化优势：DeepSeek支持最长达16Ktok...
- Python绘制可爱的图表 cutecharts
-
一个很酷的python手绘样式可视化包——可爱的图表cutecharts。Cutecharts非常适合为图表提供更个性化的触感。Cutecharts与常规的Matplotlib和Seabo...
- 第十二章:Python与数据处理和可视化
-
12.1使用pandas进行数据处理12.1.1理论知识pandas是Python中最常用的数据处理库之一，它提供了高效的数据结构和数据分析工具。pandas的核心数据结构是Serie...
- 5分钟就能做一个Excel动态图表，你确定不学学?(纯gif教学)
-
本文说明下图是一个比较酷炫的Excel动态图表，最难的部分就是用到了一个复选框控件。其实这个控件我很早就见过，但是不会用呀！望洋兴叹。这次呢，我也是借着这个文章为大家讲述一下这个控件的使用。本文没有...
- Python数据可视化:从Pandas基础到Seaborn高级应用
-
数据可视化是数据分析中不可或缺的一环，它能帮助我们直观理解数据模式和趋势。本文将全面介绍Python中最常用的三种可视化方法。Pandas内置绘图功能Pandas基于Matplotlib提供了简洁的绘...
- 如何使用 Python 将图表写入 Excel
-
将Python生成的图表写入Excel文件是数据分析和可视化中常见的需求。Python提供了多种库（如matplotlib、openpyxl和xlsxwriter）来实现这一功能。本文...
- Excel 图表制作太痛苦?用 Python 生成动态交互图表
-
做个动态图表花了3小时？你该换方法了！上周帮销售部做季度汇报图表，Excel操作把我整崩溃了——插入折线图后发现数据源选错，重新选择又得调格式想做动态筛选图表，捣鼓"开发工具"...
- Python Matplotlib 入门教程:可视化数据的基石
-
一、简介Matplotlib是Python中最流行的数据可视化库，提供从简单折线图到复杂3D图形的完整解决方案。其核心优势在于：o灵活性强：支持像素级样式控制o兼容性好：与NumPy、Pa...
- 20种Python数据可视化绘图 直接复制可用
-
本文介绍20种python数据绘图方法，可直接用于科研绘图或汇报用图。1.折线图(LinePlot)-描述数据随时间或其他变量的变化。importmatplotlib.pyplotasp...
- Python os模块完全指南:轻松玩转文件管理与系统操作
-
Pythonos模块完全指南：轻松玩转文件管理与系统操作os模块是Python与操作系统对话的"瑞士军刀"，学会它能让你轻松管理文件、操控路径、获取系统信息。本教程通过场景化案例+...
- Python中h5py与netCDF4模块在Anaconda环境的下载与安装
-
本文介绍基于Anaconda环境，下载并安装Python中h5py与netCDF4这两个模块的方法。h5py与netCDF4这两个模块是与遥感图像处理、地学分析等GIS操作息息相关的模块，应用...
- python中的模块、库、包有什么区别?
-
一文带你分清Python模块、包和库。一、模块Python模块(Module)，是一个Python文件，以.py结尾，包含了Python对象定义和Python语句。模块能定义函数，类和变...
- centos7 下面使用源码编译的方式安装python3.11
-
centos7下面使用源码编译的方式安装python3.11，步骤如下：cd/root#只是将python3.11的安装包下载到/root目录下wgethttps://www.python.o...
- Python其实很简单 第十四章 模块
-
模块是一组程序代码，可以是别人已经写好的，也可以是自己编写的，但都是已经存在的，在编程时直接使用就可以了。模块机制的最大好处就是程序员不再编写重复的代码，而直接利用已有的成果，这样就能将更多的精力投入...
欢迎 你 发表评论:
- 一周热门
- 最近发表
- 标签列表
-
- python计时 (73)
- python安装路径 (56)
- python类型转换 (93)
- python进度条 (67)
- python吧 (67)
- python的for循环 (65)
- python格式化字符串 (61)
- python静态方法 (57)
- python列表切片 (59)
- python面向对象编程 (60)
- python 代码加密 (65)
- python串口编程 (77)
- python封装 (57)
- python读取文件夹下所有文件 (59)
- java调用python脚本 (56)
- python操作mysql数据库 (66)
- python获取列表的长度 (64)
- python接口 (63)
- python调用函数 (57)
- python多态 (60)
- python匿名函数 (59)
- python打印九九乘法表 (65)
- python赋值 (62)
- python异常 (69)
- python元祖 (57)